Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ColqO35348 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ColqO35348 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ColqO35348 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ColqO35348 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ColqO35348 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ColqO35348 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ColqO35348 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms