Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Kpna3O35344 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms