Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ebi3O35228 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ebi3O35228 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ebi3O35228 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ebi3O35228 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ebi3O35228 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ebi3O35228 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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