Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ArxO35085 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ArxO35085 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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