Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms