Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MttpO08601 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MttpO08601 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MttpO08601 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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MttpO08601 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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MttpO08601 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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MttpO08601 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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MttpO08601 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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MttpO08601 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MttpO08601 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MttpO08601 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MttpO08601 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MttpO08601 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MttpO08601 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MttpO08601 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MttpO08601 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MttpO08601 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MttpO08601 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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MttpO08601 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MttpO08601 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MttpO08601 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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MttpO08601 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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MttpO08601 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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MttpO08601 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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MttpO08601 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MttpO08601 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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MttpO08601 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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MttpO08601 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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MttpO08601 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MttpO08601 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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