Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3542K7N6U2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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