Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Gm21310J3QQ23 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Gm21310J3QQ23 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gm21310J3QQ23 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gm21310J3QQ23 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gm21310J3QQ23 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gm21310J3QQ23 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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