Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5225J3QPL3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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