Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5294J3QP53 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
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