Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm21900J3QP38 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm21900J3QP38 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm21900J3QP38 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm21900J3QP38 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm21900J3QP38 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm21900J3QP38 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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