Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm20918J3QN17 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm20918J3QN17 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20918J3QN17 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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