Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm20825J3QM67 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms