Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sh3tc1G3X9F6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sh3tc1G3X9F6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sh3tc1G3X9F6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sh3tc1G3X9F6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sh3tc1G3X9F6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sh3tc1G3X9F6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sh3tc1G3X9F6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3tc1G3X9F6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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