Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ScaperF8VQ70 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ScaperF8VQ70 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ScaperF8VQ70 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ScaperF8VQ70 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ScaperF8VQ70 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ScaperF8VQ70 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ScaperF8VQ70 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ScaperF8VQ70 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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