Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm28048F7BCN0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm28048F7BCN0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28048F7BCN0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm28048F7BCN0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm28048F7BCN0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm28048F7BCN0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm28048F7BCN0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm28048F7BCN0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm28048F7BCN0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm28048F7BCN0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm28048F7BCN0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm28048F7BCN0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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