Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21977F6U3N7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gm21977F6U3N7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gm21977F6U3N7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Gm21977F6U3N7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Gm21977F6U3N7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21977F6U3N7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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