Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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