Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rdh16f1E9Q9P8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh16f1E9Q9P8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh16f1E9Q9P8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rdh16f1E9Q9P8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rdh16f1E9Q9P8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rdh16f1E9Q9P8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rdh16f1E9Q9P8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rdh16f1E9Q9P8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Rdh16f1E9Q9P8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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