Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo5cE9Q1F5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms