Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fndc1E9Q043 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms