Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp54bE9PXC0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms