Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms