Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms