Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm6685D3YYP3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm6685D3YYP3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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