Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ube2d4D3YUH6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms