Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cttnbp2B9EJA2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cttnbp2B9EJA2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms