Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cspp1B2RX88 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms