Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms