Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AU015836B2RUM3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms