Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprbB2RU80 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprbB2RU80 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms