Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp42B2RQC2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp42B2RQC2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms