Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms