Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms