Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Scn3aA2ASI5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Scn3aA2ASI5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Scn3aA2ASI5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scn3aA2ASI5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scn3aA2ASI5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scn3aA2ASI5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scn3aA2ASI5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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