Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SetxA2AKX3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms