Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frmpd4A2AFR3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms