Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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