Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm8048-201ENSMUST00000182555 996 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm43322-201ENSMUST00000196232 1612 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3238W4VSP7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms