Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms