Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Crlf3Q9Z2L7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Crlf3Q9Z2L7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Crlf3Q9Z2L7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Crlf3Q9Z2L7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Crlf3Q9Z2L7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Crlf3Q9Z2L7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Crlf3Q9Z2L7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Crlf3Q9Z2L7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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