Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms