Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms