Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ilf3Q9Z1X4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms