Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn4Q9WU22 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms