Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Col4a4Q9QZR9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Col4a4Q9QZR9 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Col4a4Q9QZR9 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Col4a4Q9QZR9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Col4a4Q9QZR9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Col4a4Q9QZR9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Col4a4Q9QZR9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Col4a4Q9QZR9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Col4a4Q9QZR9 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Col4a4Q9QZR9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Col4a4Q9QZR9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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