Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk3Q9QZL0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms