Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnt3Q9QZ47 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms