Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

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Length 761 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Phtf1Q9QZ09 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Phtf1Q9QZ09 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Phtf1Q9QZ09 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Phtf1Q9QZ09 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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