Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2e3Q9QXZ7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nr2e3Q9QXZ7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms